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生体細胞のプログラミング言語をつくるオープンソースプロジェクト

生体細胞のプログラミング言語を… 2013/05/01 22:22

http://wired.jp/2013/04/25/bio-fab-open-source-language/
生体細胞のプログラミング言語をつくるオープンソースプロジェクト
人体のプログラミング言語開発を目指す、新たな動きが始まっている。SF小説のような話だが同プロジェクトはすでに進行中で、開発された言語はオープンソースとして公開される見込みだ。
TEXT BY DANIELA HERNANDEZ
TRANSLATION BY WATARU NAKAMURA
http://www.wired.com/wiredenterprise/2013/04/bio-fab-open-source-language/
2145341.jpg

“Digital” By Steve Jurvetson (CC:BY)
Digital
Photo of the plastic grating on Watson’s book DNA (from another angle, it shows a bee on yellow flowers). It was a great honor to have him sign it at The Future of Life conference. Here’s a photo of Watson now, and as a 24 years old… when his two hour brainstorm with Crick changed the world.
Note: the ripples of the Moire pattern on the right depends on the image size. It is not pronounced in the original size photo.

人体のプログラミング言語開発を目指す、新たな動きが始まっている。

BIOFAB(International Open Facility Advancing Biotechnology)の共同代表であるドリュー・エンディらの研究チームは、遺伝子データを実際に生体細胞プログラムに利用するためのプログラミ ング言語開発を進めているという。SF小説のような話だが同プロジェクトはすでに進行中で、開発された言語はオープンソースとして公開される見込みだ。これにより同言語は外部の研究者にも利用され、より正確なものに修正されていくことが期待されている。

エンディ氏らの取り組みは、遺伝子データについてさらに理解を進め、人体の機能に直接手を加えられるようにする「バイオエンジニアリング」と呼ばれる研究分野に含まれるもの。人間の遺伝子を対象にした特許の有効性をめぐっては(日本語版記事)、米最高裁の審理が目下行われているところで、同分野は大きな曲がり角に差し掛かっているが、エンディ氏のような研究者らは同技術のさらなる発展を目指している。

遺伝子は人体の細胞の機能を定義する情報を持っており、一部のゲノム(遺伝情報)は異なる細胞や有機体のものでも同じように遺伝子を発現させる。エンディ 氏らが遺伝子の発現を操作するためのプログラミング言語を開発できる可能性があるのはこのためで、彼らはこの言語について「ゲノムと生命のダイナミックな プロセスの間にある層(the layer between the genome and all the dynamic processes of life)」と呼んでいる。

カーネギーメロン大学の計算生物学者であるジヴ・バー・ジョセフによれば、遺伝子の発現はコンピューターシステム間の伝達方法とそれほど変わりなく、どの システムにも同じような動作が見られるという。実際、コンピューターは1960年代から、細胞や他の生体システムと同じように働くよう開発されてきた。生体システムは、情報のスタンダードな伝達手段を備えた自己完結したシステムだからだ。

BIOFABのプロジェクトは現在初期段階にあり、エンディ氏らはプログラミング言語のもっとも基本的な要素である構文をつくっているところだ。サイエンス誌によれば、同研究チームは最近まで、ゲノムから細胞に送られる信号をコントロールし、増幅する方法をつくっていたという。
遺伝子がプログラムなら、病気はバグかな?
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